한국과학기술원(KAIST) 생명과학과 정인경 교수팀이 서울대 암연구소 김태유 교수팀과 함께 세계 최초로 대장암 환자의 3차원 게놈 지도를 완성했다. 한국인 대장암 환자의 3차원 게놈 지도는 인공지능 기반의 알고리즘을 활용했다. 정 교수는 24일 "기존의 점돌연변이나 유전체 변이만으로는 설명이 어려운 암 유전체를 3차원 게놈 구조 관점에서 재해독하고 신규 암 타겟을 발굴할 수 있는 수 있는 새로운 접근법을 제시했다"고 설명했다. 연구진은 이 게놈 지도로 암 세포 특이적인 유전자 조절 현상을 통해 특정 종양유전자들이 과하게 표출되는 현상을 밝혀냈다. 김 교수는 "이 결과는 개별 암 환자들마다 서로 다르게 나타나는 종양 이질성을 이해하는 데 매우 중요한 요소가 될 수 있으며, 이를 이용한 환자 맞춤형 치료 연구의 시발점이 될 것"이라고 말했다. 연구진은 암 세포에서만 나타나는 특별한 '염색질 고리' 구조가 유전자 발현 촉진 인자인 '인핸서'와 종양유전자 사이의 상호작용을 형성해 과하게 생기도록 유도하는 '인핸서 납치' 현상에 초점을 뒀다. monarch@fnnews.com 김만기 기자

[파이낸셜뉴스] 한국과학기술원(KAIST) 생명과학과 정인경 교수팀이 서울대 암연구소 김태유 교수팀과 함께 세계 최초로 대장암 환자의 3차원 게놈 지도를 완성했다. 한국인 대장암 환자의 3차원 게놈 지도는 인공지능 기반의 알고리즘을 활용했다. 정 교수는 24일 "기존의 점돌연변이나 유전체 변이만으로는 설명이 어려운 암 유전체를 3차원 게놈 구조 관점에서 재해독하고 신규 암 타겟을 발굴할 수 있는 수 있는 새로운 접근법을 제시했다"고 설명했다. 연구진은 이 게놈 지도로 암 세포 특이적인 유전자 조절 현상을 통해 특정 종양유전자들이 과하게 표출되는 현상을 밝혀냈다. 김 교수는 "이 결과는 개별 암 환자들마다 서로 다르게 나타나는 종양 이질성을 이해하는 데 매우 중요한 요소가 될 수 있으며, 이를 이용한 환자 맞춤형 치료 연구의 시발점이 될 것"이라고 말했다. 연구진은 암 세포에서만 나타나는 특별한 '염색질 고리' 구조가 유전자 발현 촉진 인자인 '인핸서'와 종양유전자 사이의 상호작용을 형성해 과하게 생기도록 유도하는 '인핸서 납치' 현상에 초점을 뒀다. 특히 게놈간의 공간상 상호작용을 측정할 수 있는 대용량 염색체 구조 포착 'Hi-C' 실험 기법을 활용해 대장암 3차원 게놈 지도를 작성했다. 이를 통해 대장암 특이적 3차원 게놈 변화를 환자 개개인별로 분석할 수 있는 AI 기반 알고리즘을 개발했다. 이를 통해 광범위한 규모의 3차원 게놈 구조 변화와 이로 인한 다양한 종양유전자의 활성화를 확인했다. 이를 통해 암 특이적 3차원 게놈 구조의 변화로 인한 종양유전자 활성 현상을 명확히 제시했다. 이로 인한 환자 예후와 약물 반응 등 임상적인 특성과의 연관성까지 제시해 맞춤 치료 원천기술을 확보했다.  monarch@fnnews.com 김만기 기자

【파이낸셜뉴스 울산=최수상 기자】 울산시는 22일~24일 사흘간 울산 유에코(UECO)에서 ‘게놈·바이오 엑스포 2022’를 개최한다고 21일 밝혔다. 울산시가 주최하고, 유니스트(UNIST) 주관으로 열리는 올해 행사는 ‘게놈에서 노화까지: 한국인 만 명 게놈 사업을 넘어서’라는 주제로 한국인 만 명 게놈 사업 관련 연구와 기술개발 중심의 최신 게놈 연구 성과 공유, 유전체 연구의 상용화와 산업화 발전 방향 모색을 한다. 1일차에는 노화와 질병을 주제로 전문가들을 위한 국제적 석학들의 ‘국제 게놈 학술토론회(심포지엄)’가, 2일차에는 관련 기업들과 투자사 간 ‘투자 상담회’가 진행된다. 3일차에는 ‘과학과 과학이 주는 기회’에 대한 2006년 노벨상 수상자 앤드루 파이어(Andrew Fire) 교수와의 대담회, 최신 게놈 해독 기술과 진단 기술을 주제로 관련 기업들의 ‘게놈 산업 세미나’, 기업홍보, 채용절차 등을 소개하는 직업박람회(Job Fair)가 열린다. 행사기간 동안 게놈과 노화를 주제로 한 시민 대상 강좌, DNA 나선구조 모형 만들기, 과학 놀이들을 통한 직업체험 등 다양한 시민체험 행사도 열린다. 40여개의 국내·외 관련 기업의 전시, 울산 만 명 게놈 프로젝트 참여자들을 대상으로 하는 게놈리포트 이야기 마당(토크콘서트) 등 부대행사도 준비했다. ulsan@fnnews.com 최수상 기자

[파이낸셜뉴스] 인바이츠바이오코아가 전립선암 등 특정질환에 대한 유전체 기반의 전주기적 진단플랫폼 개발 및 구축 업체 프로카젠을 인수했다. 프로카젠은 국내 최대 유전체 데이터 규모인 전립선암 환자 7000명 데이터베이스(DB)를 향후 1만명까지 늘릴 계획이 있는 바이오 벤처다. 이에 인바이츠 생태계(인바이츠바이오코아, 인바이츠헬스케어, 헬스커넥트, 인바이츠지노믹스)가 추진하는 메타버스 기반 제주 게놈 프로젝트도 속도를 낼 전망이다. 제주 게놈 프로젝트는 유전체를 비롯한 각종 건강정보를 수집·분석 융합해 헬스케어 빅데이터를 구축하고, 개인맞춤형 건강관리 및 정밀 의료체계를 메타버스 상에서 구현하는 것이 골자다. 인바이츠바이오코아는 프로카젠 지분 85%를 약 127억원에 양수한다고 15일 밝혔다. 경영권 확보다. 프로카젠의 기업가치(EV)는 약 153억원으로 평가됐다. 프로카젠은 서울의대 및 분당서울대병원 비뇨의학과 변석수 교수가 창업한 바이오벤처다. 변 교수는 향후 인바이츠 생태계 최고기술책임자(CTO)로써 메타버스 기반 제주 게놈 프로젝트 전반을 총괄해 나갈 예정이다. 앞서 인바이츠 생태계는 지난 3월 관·산·학·병·연에 걸친 19개의 기관과 협력 인프라를 구축했다. 지난 달에는 프로젝트 수행의 거점이 될 제주에 현지 법인을 설립했다. 차세대염기서열 분석검사(NGS) 및 마이크로어레이(Microarray) 임상검사 부문에서 미국병리학회(CAP) 인증을 받기도 했다. 글로벌 최고 수준의 유전체 분석 역량을 입증한 셈이다. IB(투자은행) 업계 관계자는 "유전체 분석 역량과 함께 게놈 프로젝트 성공의 관건이 되는 것이 데이터 분석 역량"이라며 "국내 최대의 전립선암 유전체 기반의 데이터 분석 역량과 인력을 보유한 프로카젠을 편입, 인바이츠 생태계는 메타버스 기반 제주 게놈 프로젝트를 위한 또 하나의 핵심 추진체를 장착한 셈"이라고 말했다.   ggg@fnnews.com 강구귀 기자

【파이낸셜뉴스 울산=최수상 기자】 게놈서비스의 사업화를 위한 본격적인 실증이 울산에서 시작됐다. 이번 실증은 유전정보 분석체계 고도화 및 서비스 제공, 질환별 진단 키트 개발 등을 목표로 추진된다. 4일 울산시에 따르면 바이오헬스케어 관련 서비스를 제공하기 위해서는 수준 높은 양질의 대용량 바이오데이터가 필요하지만 관련 규제로 인해 사업화에는 한계가 있었다. 울산 게놈서비스산업 규제자유특구에서는 이 같은 문제를 해소, 사업화에 필요한 유전정보의 이용 범위와 관련 규제가 완화돼 다양한 실증 작업이 가능하다. 이번에 진행되는 실증은 바이오데이터팜(대용량 바이오 빅데이터를 저장하고 고속 분석하는 슈퍼컴퓨터) 구축 및 운영과 질환별 진단 마커 개발, 감염병 발생 대응 온라인 체제 플랫폼 구축 등 3개 세부사업으로 추진된다. 바이오데이터팜은 유전, 의료정보 관련 바이오 빅데이터를 수집.분석.관리하면서 양질의 바이오 빅데이터를 기업 등에 제공하게 된다. 진단 마커는 바이오데이터팜에서 제공하는 바이오 빅데이터를 활용해 질환별로 정밀하게 위험도를 예측하는 도구이다. 감염병 질환자의 데이터 분석을 통해서는 감염병 진단 키트 및 백신, 치료제 후보 물질을 개발하게 된다. 실증이 완료되면 개인 맞춤형 진단.치료 등 신의료기술 개발뿐만 아니라 감염병 대응 역량까지 강화될 것으로 기대된다. 특히 울산시는 이번 실증 사업을 통해 게놈서비스 산업의 안전성을 입증하고, 그 결과를 토대로 규제법령 정비도 추진해 나갈 계획이다. 박순철 울산시 혁신산업국장은 “게놈서비스산업 규제자유특구 실증 사업을 통해 게놈데이터의 상용화 가능성을 입증해 나가겠다”며 “울산이 게놈 기반의 바이오 산업 중심지 역할을 해나가도록 노력하겠다”라고 말했다. ulsan@fnnews.com 최수상 기자

【파이낸셜뉴스 울산=최수상 기자】 울산 유전체(게놈)서비스산업 규제자유특구 사업의 핵심 결과물인 ‘바이오데이터팜’이 3일 개소식 갖고 본격적인 운영에 들어갔다. 개소식에서는 울산시와 SK바이오사이언스, 울산대, 유니스트(UNIST), 울산과학대, 울산대병원, 울산병원 등이 참여한 바이오헬스산업 육성 업무협약식도 함께 열렸다.    ‘울산 게놈서비스산업 규제자유특구 바이오데이터팜’은 울산 바이오산업의 성장을 주도할 획기적인 사업으로 주목받고 있다. 디지털 바이오헬스를 실현할 유전, 의료 관련 종합 바이오데이터를 구축함으로써 유전, 의료정보 관련 바이오데이터의 수집·저장·관리 시스템을 구축·운영하게 된다. 총 2년간 약 197억 원이 투입되며 1만명 유전체 정보를 60일 이내 기초 분석할 수 있는 수준의 고성능 컴퓨팅 시스템으로 구축된다. 바이오데이터팜 구축 사업을 통해 조성된 인프라는 향후 질환별 진단마커 개발, 감염병 대응 온라인 플랫폼 등 유전체 서비스 실증사업에 활용될 예정이다. 향후 울산시가 추진 중인 게놈 바이오메디컬 육성사업과의 연계를 통해 울산이 유전체 서비스 산업의 글로벌 허브로 성장하는데 크게 기여할 전망이다. 울산시 관계자는 “바이오데이터팜 시스템을 활용해 울산 유전체 서비스 특구사업이 성공적으로 추진되면 핀란드 핀젠 프로젝트처럼 많은 바이오 기업과 제약회사를 유치할 수 있을 것으로 기대한다.”고 말했다. 아울러 “울산 바이오헬스산업 육성을 위한 업무협약을 바탕으로 바이오헬스 기업을 유치하고 우수한 인력을 육성하여 새로운 일자리가 만들어지는 선순환 구조를 만들어 가겠다.”라고 덧붙였다.   한편 ‘바이오헬스산업 육성 업무협약’은 유전·의료 관련 종합 인공지능 데이터를 구축하고 이를 활용한 건강 관리(헬스케어), 정밀의료 서비스 산업화 등을 위해 추진됐다. 협약 내용은 울산 바이오헬스산업 육성전략 성과 창출에 필요한 공동 협력, 바이오헬스 분야 연구개발 추진을 위한 공동 협력 등이다. ulsan@fnnews.com 최수상 기자

【파이낸셜뉴스 울산=최수상 기자】 울산시와 울산정보산업진흥원이 ‘바이오데이터팜' 시스템 구축에 본격 나선다. 11일 울산시에 따르면 이번에 구축하는 ‘바이오데이터팜 시스템’은 중소벤처기업부 주관 규제자유특구사업 중 바이오데이터팜 구축·운영사업의 일환으로, 총 2년간 120여억 원이 투입된다. 2021년 도입 규모는 CPU 9804 core, 메모리 265 TB(테라바이트), 스토리지 80 PB(페타바이트)으로, 1만명 게놈 데이터를 60일 이내 기초분석이 가능한 고속연산용 고성능컴퓨팅 시스템이다. 이번 사업을 통해 조성된 인프라는 질환별 진단마커, 감염병 대응 플랫폼 등 게놈서비스 실증 사업에 활용될 예정이다. 향후 울산시에서 계획한 게놈바이오메디컬 육성사업과의 연계를 통해, 울산이 게놈서비스 산업의 글로벌 허브로 성장하는데도 크게 기여할 전망이다. 한편 ‘게놈서비스산업 규제자유특구’는 울산과학기술원(UNIST)과 테크노일반산업단지 등 5곳에 1.19㎢ 규모로 조성된다. 지난 2020년 12월~2022년 11월 2년간 총 사업비 407억 원(국비 216억, 시비 171억, 민자 20억)이 투입된다. 주요 추진사업은 △유전정보 분석과 산업적 활용을 위한 바이오데이터 팜 구축·운영 실증 △심혈관질환·우울증 등 질환맞춤형 진단마커 개발 △감염병 대응을 위한 유전체 분석 및 치료제 개발 기반 구축 등이다. 울산정보산업진흥원 관계자는 “바이오데이터팜 시스템을 활용해 울산 게놈서비스 특구사업이 성공적으로 추진되면, 핀란드 핀젠 프로젝트처럼 많은 바이오기업과 제약회사를 유치할 수 있을 것"이라며, 추가적인 진단기기, 시약, 치료제 개발 등이 가능해질 것으로 기대한다”고 말했다. ulsan@fnnews.com 최수상 기자

[파이낸셜뉴스] 클리노믹스와 울산과학기술원(UNIST) 게놈산업기술센터 공공 연구팀은 코로나19 치명률과 국가별 TMPRSS2 유전자의 V197M 변이의 빈도가 유의한 상관관계가 있음을 밝혀 분자세포생물학 연구저널(Molecules and Cells)에 관련 논문을 9월 30일 발표했다고 5일 밝혔다. 이에 따르면 TMPRSS2라는 코로나 바이러스 관련 유전자의 특정 변이의 빈도와 국가별 치명률이 상관관계를 보이고, 특히 197번째 발린(V) 아미노산이 메치오닌(M)으로 바뀌면 코로나에 더 저항성이 있는 것으로 알려졌다. 한국인은 유럽인 등에 비해 이 변이를 가진 사람이 많아 코로나 바이러스에 더 저항성이 있을 수 있음을 밝힌 것이다. 코로나 바이러스는 우리 몸의 TMPRSS2 라는 효소에 의해서 한 번 잘려야 몸 속에 침투가 가능하다 코로나 바이러스가 들어 붙는 ACE2단백질과 더 잘 붙어서 침입을 더 잘하게 된다. 연구팀은 울산 만명게놈 프로젝트의 2262명의 게놈 데이터를 포함한 총 22만3760명의 전 세계 게놈 데이터를 활용해 특수한 유전자 변이가 코로나 바이러스 위험도에 영향을 주는지 확인하기 위해 대형 바이오 빅데이터 분석을 진행했다. 그 결과, TMPRSS2 효소를 만드는 유전자 내부에 있는 모든 아미노산 등을 바꾸는 모든 유전자 변이를 생정보학적으로 훓어서 유전변이들의 국가별 빈도와 국가별 코로나 사망율을 비교하니, 통계적으로 상관관계가 있는 V197M 변이를 찾아 냈다. 이 V197M유전자 변이는 한국, 일본과 같은 동아시아 국가에서는 발생 빈도가 상당히 높은 반면, 프랑스, 이탈리아과 같은 유럽 국가에서는 발생 빈도가 낮다. 이 유전자 변이의 생물학적 의미를 더 확인하기 위해, 연구팀은 코로나 바이러스 단백질과 사람 단백질의 3차원 구조 예측을 통해서 이 V197M 변이가 TMPRSS2 효소를 불안정하게 만들 수 있음을 예측했다. 이것은 코로나 바이러스의 인체 침입을 더 힘들게 만들 수 있다는 의미다. 앞으로 더 많은 경증, 중증, 사망자들의 게놈을 분석하면 이런 민족별 유전변이의 빈도가 어떻게 코로나 바이러스의 치명도에 영향을 주는지 알 수 있게 될 것으로 기대된다. 회사 관계자는 "본 연구는 클리노믹스가 참여하는 울산 만명게놈사업 데이터를활용하여 추진됐으며 한국인의 표준 유전자 변이정보 데이터베이스로 큰 의미가 있다"며 "클리노믹스는 게놈전문 회사로서 코로나 바이러스의 진단키트, 진단서비스를 현재 진행하고 있으며 코로나 바이러스 자체와 코로나 바이러스가 촉발한 질병과 후유증에 관련된 연구를 지속하고 있다"고 말했다. dschoi@fnnews.com 최두선 기자

한국인 1만명의 게놈 해독이 완료됐다. 1만여명의 게놈 데이터는 우리나라 국민에 맞는 디지털 헬스케어, 정밀의료, 신약개발 등 첨단 바이오분야에 활용될 계획이다. 울산과학기술원(UNIST)과 울산광역시는 26일 2016년부터 시작한 '울산 만명 게놈프로젝트'를 통해 한국인 1만명 게놈 해독 완료를 선언했다. 유전자와 염색체를 통칭하는 게놈은 바이오산업의 반도체로 불린다. 1만명 게놈 프로젝트를 통해 확보된 데이터, 인프라와 노하우는 바이오헬스 분야의 혁신적 경쟁력이 될 것으로 전망된다. 이번 프로젝트는 180억원을 투입해 현재까지 건강인 4700명, 질환자 5300명 등 총 1만44명의 한국인 게놈 정보를 수집, 해독했다. 울산 만명 게놈프로젝트는 '한국인 1만명의 게놈 정보'와 '국내 최고 수준의 슈퍼컴퓨팅 분석 인프라 구축'이라는 성과를 거뒀다. 한국인 1만명의 게놈 정보는 한국인의 표준 유전자 변이정보 데이터베이스로서 그 가치가 크다. 차세대 게놈 사업의 핵심인 '다중오믹스 빅데이터'로 활용될 수 있기 때문이다. 이번 사업에서는 혈액, 타액 등을 통해 수집된 게놈, 전사체, 외유전체 등 오믹스 정보와 건강검진정보, 임상정보, 생활습관정보 등이 종합적으로 구축됐다. 이 데이터는 통합 분석을 통해 특정 질병의 원인에 대한 변화를 찾는 '다중오믹스 분석'에 활용될 수 있다. 한층 더 정밀한 유전적 질환 분석이 가능해질 수 있는 것이다. 게놈 분석을 위한 고성능 인프라 구축도 큰 성과다. UNIST 게놈산업기술센터(KOGIC)는 수년간 대량의 게놈 정보분석을 위해 초고성능, 고집적 연산 전자장비와 대용량 저장공간을 구축해왔다. 빅데이터의 효율적 분석을 위한 자체 기술력 향상도 이어져 자동화된 파이프라인을 통한 수천명의 전장 게놈 기초분석이 진행되고 있다. UNIST 바이오메디컬공학과 박종화 교수는 "이번 프로젝트는 국민들의 자발적 참여를 바탕으로, 한국인의 유전적 다형성을 정밀하게 지도화 했다는 데 큰 의미가 있다"고 설명했다. monarch@fnnews.com 김만기 기자

【파이낸셜뉴스 울산=최수상 기자】 울산시와 UNIST(울산과학기술원)는 26일 ‘울산 만명 게놈 프로젝트’ 완료 선언식을 가졌다. 우리나라 국민 1만명의 게놈 정보를 5년에 걸쳐 모두 해독해 데이터화 했다. 지난 2016년에 시작한 '울산 만명 게놈 프로젝트'에는 지금까지 건강인 4700여 명과 질환자 5300여 명 등 모두 1만 44명이 참여했다. 이날 행사에 참석한 각 연령별 기증자 대표와 송철호 시장(왼쪽에서 세번째), 이용훈 총장(왼쪽 네번째), 박종화 교수(오른쪽 두 번째)가 핸드프린팅으로 이를 기념했다. ulsan@fnnews.com 최수상 기자